penso che con 3000-3500 L intenda il litraggio minimo totale per far stare bene tutti i tuoi animali insieme. E non 3000 litri a capo. Comunque considera che i pesci che hai, pesci rossi e koi, crescono molto e solo loro da adulti avranno bisogno di minimo 1500/2000 litri in totale. Quindi i 3000/3500 litri all'inizio potrebbero sembrare un'esagerazione, ma considerando anche gambusie e tartarughe ci stanno tutti.
Non sono una veterinaria ma la micosi potrebbe essere dovuta, secondo me, dall'eccessivo numero di animali in pochi litri. Nel senso che, essendo in troppi in troppo poco spazio, gli animali (soprattutto le tartarughe) sporcano eccessivamente l'acqua che di conseguenza fa ammalare gli animali. Ma è una mia ipotesi eh.