Le tartarughe avendo i polmoni chiusi nel carapace devono per respirare necessariamente movimentare altri organi e per questo che respirando muovono le zampe anteriori e anche l'attaccatura del collo: credo che quel fenomeno da te notato sia del tutto normale e ti conviene controllare altre anomalie di comportamento quali apatia, scarsa vivacità ,inappetenza ma ovviamente per un periodo di osservazione abbastanza lungo(una settimana).