Acqua acquario marroncina che fare?? Filtro pratiko 300!

Salve ragazzi, è da un bel pò che non vi scrivo.. La tartaruga sta benone, abbiamo finito la cura e non fa altro che mangiare e nuotare..
Come sapete ho allestito per lei un vascone di 90x50x43.. L'ho riempito a meta', filtro pratiko 300 e riscaldatore jawer..
Il problema è l'acqua, è marroncina, prima era limpidissima.. Il filtro è stato riempito con tutti cannolicchi.. Adesso è in funzione da 1 mese e mezzo circa..
Un giorno si e un giorno no, sifono il fondo, per le feci e raccolgo le verdure avanzate.. Tolgo dunque un secchio d'acqua e ne metto 1 altro con acqua decantata.. E' ora di pulire il filtro??
Perchè subito dopo che pulisco la vasca, la tarta fa di nuovo i suoi bisogni??? Cose da pazzi.. Bella pulita le potrà durare circa 10 min!!
Attendo consigli, non so che fare...E' molto brutto da vedere!!