Aiuto gestione e creazione di habitat trachemys scripta

Salve a tutti, vi scrivo perchè ho davvero bisogno del vostro aiuto:
Un paio di mesi fa mi è stata regalata una tartaruga trachemys scripta elegans (che ho già provveduto a denunciare) perchè il precedente proprietario non era più in grado di tenerla. La tartaruga ha il carapace di circa 12cm in lunghezza, anche se non sono in grado di stimarne l'età (dovrebbe avere più di due anni, sicuramente).
Il problema è che per tutta la sua vita è stata in una bacinella con acqua troppo bassa (10-15cm) e alimentata principalmente con pellet.
Nonostante questo la tartaruga sembra essere in uno stato di salute accettabile (non presenta deformazione del carapace nè escoriazioni della pelle, ha colori vivaci e si nutre attivamente) tranne un problema che si sta presentando: delle macchie bianco/grigie dalla forma irregolare che stanno crescendo al confine dei singoli scuti e in alcune zone sotto il piastrone, in modo abbastanza esteso (appena possibile aggiornerò la discussione con delle foto per farvi capire meglio la situazione).
Queste macchie era già presenti in parte quando mi è stata data (a fine inverno) e può essere che con lo stess dello spostamento e la mancanza di sole il tutto è degenerato, ma temo che il mio comportamento in qualche modo abbia peggiorato ulteriormente la situazione.
Attualmente (ahimè) sono costretto a tenere la tartaruga nelle stesse condizioni in cui stava prima, cioè nella bacinella con acqua alta 15cm e una piccola zona all'asciutto, che però non sembra visitare troppo volentieri. La sto nutrendo sempre con i pellet che mi ha dato il precedente proprietario, ma ho aggiunto alla dieta radicchio e tarassaco, e a breve comincerò a darle del pesce. Ancora non sono riuscito a procurarmi un osso di seppia da lasciare nell'acqua, purtroppo.
Ho cambiato l'acqua (circa 8-9 litri) un paio di volte al mese, poichè non avendo a disposizione nessuna pompa o substrato l'acqua diventa troppo torbida e non so proprio come altro fare per mantenerla pulita, nonostante sia una cosa sbagliatissima da fare.
Seguendo altre discussioni qui nel forum ho capito che le macchie potrebbero essere calcare, micosi o addirittura una infezione batterica! (Sono molto preoccupato) Come devo comportarmi con la malattia? Credo che esposizione solare e una dieta migliore le faranno bene, ma se non noto nessun miglioramento la porterò presto da un veterinario!
Mentre lavoro all'acquario, come devo comportarmi per non peggiorare il problema della tartaruga?

In questo tempo ho cercato di organizzarmi per tenerla al meglio, e sono al punto di dover allestire un acquario outdoor di dimensioni 38x80x38 cm (115 litri massimi), scegliere una pompa e tutto il resto in modo da spostare il tutto dentro casa in inverno.
E qui chiedo ancora il vostro consiglio: quanta acqua dovrei tenere nell'acquario? (io avevo ipotizzato circa 80litri, cioè poco più di 25 cm di livello nel mio acquario). Quale dovrebbe essere l'estensione della zona emersa? Un filtro da 6W, 450L/H (che saranno sicuramente di meno) potrebbe andare bene? Quali e quante piante dovrei mettere?

Scusate la confusione ma le cose da dire erano tante, e io stesso sono molto indeciso sul da farsi.
Grazie per l'attenzione e per l'aiuto!