le alghe non sono di per sé sinonimo di acqua insalubre, inoltre va considerato che consumano grandi quantità di nutrienti, al pari delle piante, e competono con queste per il consumo dei nutrienti, per questo motivo le alghe scompaiono quando vi sono molte piante a crescita rapida... allo stesso tempo le alghe non rappresentano un problema, anzi hanno un potere depurante come le piante.
puoi comunque fare cambi parziali frequenti se ti senti più sicuro, con acqua decantata alla stessa temperatura della vasca.
interrare parzialmente il contenitore non lo vedo utile, piuttosto lo posizionerei in una zona ben ombreggiata, preferibilmente a nord di un muro