Io penso che dopo il primo collasso del filtro, avvenuto molto probabilmente per le piante marcite, il riaver ricominciato la maturazione senza pulire bene i cannolicchi con acqua pulita abbia fatto ripresentare il problema.
Ho riletto la discussione e ho notato che hai un legno in vasca.... l acqua giallognola sarà dovuta sicuramente ai tannini che il legno rilascia soprattutto se non lo hai bollito più volte.
Ricominciando la maturazione pulendo tutto per bene e facendo dei cambi parziali ogni 1/2 giorni dovresti essere apposto... Altrimenti non si spiega quale sia il problema